Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA5O60264 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SMARCA5O60264 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SMARCA5O60264 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SMARCA5O60264 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA5O60264 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA5O60264 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA5O60264 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMARCA5O60264 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMARCA5O60264 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMARCA5O60264 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
SMARCA5O60264 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMARCA5O60264 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMARCA5O60264 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA5O60264 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA5O60264 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMARCA5O60264 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMARCA5O60264 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMARCA5O60264 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMARCA5O60264 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SMARCA5O60264 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMARCA5O60264 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMARCA5O60264 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA5O60264 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA5O60264 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA5O60264 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMARCA5O60264 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA5O60264 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA5O60264 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA5O60264 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMARCA5O60264 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SMARCA5O60264 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA5O60264 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMARCA5O60264 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
SMARCA5O60264 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA5O60264 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMARCA5O60264 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMARCA5O60264 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMARCA5O60264 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA5O60264 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA5O60264 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMARCA5O60264 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMARCA5O60264 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMARCA5O60264 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMARCA5O60264 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMARCA5O60264 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA5O60264 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA5O60264 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA5O60264 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMARCA5O60264 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SMARCA5O60264 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SMARCA5O60264 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SMARCA5O60264 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SMARCA5O60264 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SMARCA5O60264 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SMARCA5O60264 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SMARCA5O60264 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SMARCA5O60264 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SMARCA5O60264 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SMARCA5O60264 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SMARCA5O60264 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
SMARCA5O60264 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SMARCA5O60264 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SMARCA5O60264 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SMARCA5O60264 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SMARCA5O60264 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SMARCA5O60264 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SMARCA5O60264 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SMARCA5O60264 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SMARCA5O60264 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SMARCA5O60264 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SMARCA5O60264 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SMARCA5O60264 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SMARCA5O60264 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SMARCA5O60264 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SMARCA5O60264 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SMARCA5O60264 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SMARCA5O60264 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SMARCA5O60264 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SMARCA5O60264 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SMARCA5O60264 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SMARCA5O60264 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SMARCA5O60264 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
SMARCA5O60264 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SMARCA5O60264 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
SMARCA5O60264 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SMARCA5O60264 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SMARCA5O60264 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SMARCA5O60264 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SMARCA5O60264 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
SMARCA5O60264 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
SMARCA5O60264 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SMARCA5O60264 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SMARCA5O60264 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SMARCA5O60264 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
SMARCA5O60264 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
SMARCA5O60264 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SMARCA5O60264 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SMARCA5O60264 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SMARCA5O60264 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms