Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LDB2O43679 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LDB2O43679 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LDB2O43679 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LDB2O43679 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LDB2O43679 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LDB2O43679 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LDB2O43679 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LDB2O43679 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LDB2O43679 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LDB2O43679 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LDB2O43679 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
LDB2O43679 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LDB2O43679 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LDB2O43679 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LDB2O43679 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LDB2O43679 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LDB2O43679 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LDB2O43679 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LDB2O43679 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LDB2O43679 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LDB2O43679 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LDB2O43679 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LDB2O43679 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LDB2O43679 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LDB2O43679 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LDB2O43679 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LDB2O43679 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LDB2O43679 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LDB2O43679 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LDB2O43679 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LDB2O43679 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LDB2O43679 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LDB2O43679 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LDB2O43679 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LDB2O43679 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LDB2O43679 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LDB2O43679 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LDB2O43679 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LDB2O43679 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LDB2O43679 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LDB2O43679 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LDB2O43679 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LDB2O43679 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LDB2O43679 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LDB2O43679 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LDB2O43679 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LDB2O43679 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LDB2O43679 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LDB2O43679 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LDB2O43679 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LDB2O43679 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LDB2O43679 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LDB2O43679 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LDB2O43679 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LDB2O43679 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LDB2O43679 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LDB2O43679 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LDB2O43679 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LDB2O43679 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LDB2O43679 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LDB2O43679 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LDB2O43679 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LDB2O43679 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LDB2O43679 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LDB2O43679 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LDB2O43679 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LDB2O43679 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LDB2O43679 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LDB2O43679 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LDB2O43679 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LDB2O43679 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LDB2O43679 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LDB2O43679 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LDB2O43679 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LDB2O43679 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LDB2O43679 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LDB2O43679 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LDB2O43679 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LDB2O43679 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LDB2O43679 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LDB2O43679 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LDB2O43679 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LDB2O43679 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LDB2O43679 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LDB2O43679 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LDB2O43679 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LDB2O43679 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LDB2O43679 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LDB2O43679 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LDB2O43679 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LDB2O43679 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LDB2O43679 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LDB2O43679 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LDB2O43679 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LDB2O43679 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LDB2O43679 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LDB2O43679 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LDB2O43679 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LDB2O43679 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms