Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHMP2AO43633 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHMP2AO43633 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHMP2AO43633 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHMP2AO43633 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHMP2AO43633 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHMP2AO43633 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHMP2AO43633 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHMP2AO43633 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHMP2AO43633 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHMP2AO43633 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHMP2AO43633 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHMP2AO43633 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHMP2AO43633 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHMP2AO43633 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHMP2AO43633 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHMP2AO43633 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHMP2AO43633 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHMP2AO43633 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHMP2AO43633 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHMP2AO43633 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHMP2AO43633 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHMP2AO43633 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHMP2AO43633 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHMP2AO43633 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHMP2AO43633 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHMP2AO43633 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHMP2AO43633 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHMP2AO43633 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHMP2AO43633 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHMP2AO43633 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHMP2AO43633 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHMP2AO43633 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHMP2AO43633 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHMP2AO43633 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CHMP2AO43633 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHMP2AO43633 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CHMP2AO43633 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHMP2AO43633 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHMP2AO43633 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHMP2AO43633 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHMP2AO43633 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHMP2AO43633 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHMP2AO43633 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHMP2AO43633 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHMP2AO43633 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHMP2AO43633 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CHMP2AO43633 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CHMP2AO43633 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CHMP2AO43633 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHMP2AO43633 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHMP2AO43633 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHMP2AO43633 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHMP2AO43633 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHMP2AO43633 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHMP2AO43633 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHMP2AO43633 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHMP2AO43633 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHMP2AO43633 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHMP2AO43633 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHMP2AO43633 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHMP2AO43633 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHMP2AO43633 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHMP2AO43633 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHMP2AO43633 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHMP2AO43633 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHMP2AO43633 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHMP2AO43633 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMP2AO43633 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMP2AO43633 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMP2AO43633 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHMP2AO43633 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CHMP2AO43633 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHMP2AO43633 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHMP2AO43633 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHMP2AO43633 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHMP2AO43633 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHMP2AO43633 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHMP2AO43633 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CHMP2AO43633 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHMP2AO43633 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHMP2AO43633 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHMP2AO43633 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHMP2AO43633 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CHMP2AO43633 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CHMP2AO43633 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CHMP2AO43633 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHMP2AO43633 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CHMP2AO43633 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP2AO43633 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP2AO43633 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP2AO43633 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP2AO43633 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMP2AO43633 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMP2AO43633 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMP2AO43633 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMP2AO43633 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMP2AO43633 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMP2AO43633 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHMP2AO43633 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms