Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF13O43567 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF13O43567 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF13O43567 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF13O43567 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF13O43567 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF13O43567 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF13O43567 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF13O43567 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF13O43567 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF13O43567 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF13O43567 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF13O43567 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF13O43567 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF13O43567 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF13O43567 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF13O43567 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF13O43567 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF13O43567 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF13O43567 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF13O43567 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF13O43567 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF13O43567 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF13O43567 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF13O43567 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF13O43567 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF13O43567 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF13O43567 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF13O43567 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF13O43567 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF13O43567 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF13O43567 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF13O43567 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF13O43567 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF13O43567 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF13O43567 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF13O43567 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF13O43567 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF13O43567 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF13O43567 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF13O43567 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF13O43567 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF13O43567 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF13O43567 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF13O43567 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF13O43567 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF13O43567 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF13O43567 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF13O43567 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF13O43567 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF13O43567 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF13O43567 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF13O43567 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF13O43567 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF13O43567 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF13O43567 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF13O43567 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF13O43567 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF13O43567 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF13O43567 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF13O43567 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF13O43567 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF13O43567 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF13O43567 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF13O43567 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF13O43567 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF13O43567 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF13O43567 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF13O43567 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF13O43567 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF13O43567 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF13O43567 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF13O43567 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF13O43567 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF13O43567 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF13O43567 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF13O43567 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF13O43567 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF13O43567 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF13O43567 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF13O43567 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF13O43567 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF13O43567 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF13O43567 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF13O43567 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF13O43567 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF13O43567 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF13O43567 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF13O43567 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF13O43567 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF13O43567 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF13O43567 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF13O43567 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF13O43567 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF13O43567 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF13O43567 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF13O43567 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF13O43567 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF13O43567 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF13O43567 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms