Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP8B1O43520 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP8B1O43520 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP8B1O43520 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP8B1O43520 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP8B1O43520 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP8B1O43520 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP8B1O43520 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP8B1O43520 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP8B1O43520 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP8B1O43520 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP8B1O43520 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP8B1O43520 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP8B1O43520 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP8B1O43520 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP8B1O43520 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP8B1O43520 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP8B1O43520 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP8B1O43520 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP8B1O43520 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP8B1O43520 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP8B1O43520 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP8B1O43520 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP8B1O43520 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP8B1O43520 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP8B1O43520 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP8B1O43520 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP8B1O43520 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP8B1O43520 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP8B1O43520 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP8B1O43520 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP8B1O43520 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP8B1O43520 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP8B1O43520 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP8B1O43520 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP8B1O43520 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP8B1O43520 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP8B1O43520 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP8B1O43520 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP8B1O43520 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP8B1O43520 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP8B1O43520 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP8B1O43520 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP8B1O43520 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP8B1O43520 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP8B1O43520 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP8B1O43520 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP8B1O43520 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP8B1O43520 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP8B1O43520 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP8B1O43520 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP8B1O43520 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP8B1O43520 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP8B1O43520 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP8B1O43520 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP8B1O43520 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP8B1O43520 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP8B1O43520 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP8B1O43520 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP8B1O43520 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP8B1O43520 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP8B1O43520 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP8B1O43520 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP8B1O43520 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP8B1O43520 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP8B1O43520 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8B1O43520 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8B1O43520 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8B1O43520 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8B1O43520 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8B1O43520 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8B1O43520 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP8B1O43520 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP8B1O43520 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP8B1O43520 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP8B1O43520 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP8B1O43520 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP8B1O43520 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP8B1O43520 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP8B1O43520 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP8B1O43520 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ATP8B1O43520 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP8B1O43520 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP8B1O43520 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP8B1O43520 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP8B1O43520 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP8B1O43520 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP8B1O43520 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP8B1O43520 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP8B1O43520 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP8B1O43520 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8B1O43520 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8B1O43520 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8B1O43520 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP8B1O43520 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP8B1O43520 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP8B1O43520 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP8B1O43520 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms