Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXA2O43364 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXA2O43364 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXA2O43364 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXA2O43364 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXA2O43364 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXA2O43364 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXA2O43364 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXA2O43364 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXA2O43364 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXA2O43364 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXA2O43364 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXA2O43364 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXA2O43364 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXA2O43364 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXA2O43364 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXA2O43364 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXA2O43364 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXA2O43364 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXA2O43364 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXA2O43364 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXA2O43364 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXA2O43364 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXA2O43364 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXA2O43364 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXA2O43364 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXA2O43364 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXA2O43364 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXA2O43364 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXA2O43364 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXA2O43364 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXA2O43364 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXA2O43364 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXA2O43364 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXA2O43364 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXA2O43364 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXA2O43364 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXA2O43364 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXA2O43364 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXA2O43364 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXA2O43364 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXA2O43364 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXA2O43364 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXA2O43364 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXA2O43364 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXA2O43364 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXA2O43364 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXA2O43364 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXA2O43364 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXA2O43364 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXA2O43364 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXA2O43364 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXA2O43364 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXA2O43364 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXA2O43364 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXA2O43364 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXA2O43364 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXA2O43364 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXA2O43364 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXA2O43364 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXA2O43364 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXA2O43364 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXA2O43364 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXA2O43364 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXA2O43364 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXA2O43364 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HOXA2O43364 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HOXA2O43364 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXA2O43364 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXA2O43364 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXA2O43364 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXA2O43364 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXA2O43364 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXA2O43364 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXA2O43364 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXA2O43364 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXA2O43364 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXA2O43364 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXA2O43364 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXA2O43364 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXA2O43364 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXA2O43364 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXA2O43364 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXA2O43364 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXA2O43364 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXA2O43364 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXA2O43364 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXA2O43364 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXA2O43364 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXA2O43364 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXA2O43364 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXA2O43364 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXA2O43364 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXA2O43364 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXA2O43364 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXA2O43364 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXA2O43364 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXA2O43364 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXA2O43364 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXA2O43364 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms