Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MSI1O43347 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MSI1O43347 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MSI1O43347 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MSI1O43347 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MSI1O43347 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
MSI1O43347 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MSI1O43347 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MSI1O43347 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MSI1O43347 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MSI1O43347 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MSI1O43347 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MSI1O43347 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSI1O43347 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSI1O43347 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSI1O43347 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSI1O43347 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSI1O43347 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSI1O43347 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSI1O43347 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSI1O43347 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSI1O43347 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSI1O43347 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSI1O43347 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSI1O43347 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSI1O43347 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSI1O43347 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSI1O43347 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSI1O43347 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSI1O43347 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSI1O43347 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSI1O43347 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MSI1O43347 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
MSI1O43347 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MSI1O43347 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MSI1O43347 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MSI1O43347 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MSI1O43347 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MSI1O43347 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MSI1O43347 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MSI1O43347 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MSI1O43347 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MSI1O43347 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MSI1O43347 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MSI1O43347 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MSI1O43347 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MSI1O43347 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MSI1O43347 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MSI1O43347 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MSI1O43347 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MSI1O43347 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MSI1O43347 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MSI1O43347 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MSI1O43347 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MSI1O43347 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MSI1O43347 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MSI1O43347 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MSI1O43347 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MSI1O43347 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MSI1O43347 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MSI1O43347 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MSI1O43347 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MSI1O43347 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MSI1O43347 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MSI1O43347 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MSI1O43347 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MSI1O43347 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MSI1O43347 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MSI1O43347 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSI1O43347 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MSI1O43347 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSI1O43347 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MSI1O43347 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSI1O43347 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSI1O43347 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSI1O43347 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSI1O43347 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSI1O43347 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSI1O43347 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MSI1O43347 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MSI1O43347 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MSI1O43347 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MSI1O43347 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MSI1O43347 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MSI1O43347 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MSI1O43347 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MSI1O43347 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MSI1O43347 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MSI1O43347 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MSI1O43347 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MSI1O43347 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MSI1O43347 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MSI1O43347 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MSI1O43347 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MSI1O43347 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MSI1O43347 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MSI1O43347 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MSI1O43347 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MSI1O43347 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MSI1O43347 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms