Protein–RNA interactions for Protein: O43307

ARHGEF9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF9O43307 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF9O43307 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF9O43307 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF9O43307 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF9O43307 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF9O43307 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF9O43307 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF9O43307 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF9O43307 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF9O43307 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF9O43307 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF9O43307 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF9O43307 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF9O43307 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF9O43307 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF9O43307 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF9O43307 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARHGEF9O43307 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF9O43307 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF9O43307 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF9O43307 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF9O43307 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF9O43307 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF9O43307 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF9O43307 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF9O43307 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF9O43307 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF9O43307 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF9O43307 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF9O43307 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF9O43307 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF9O43307 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF9O43307 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF9O43307 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF9O43307 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF9O43307 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF9O43307 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF9O43307 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF9O43307 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF9O43307 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF9O43307 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF9O43307 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF9O43307 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGEF9O43307 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF9O43307 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF9O43307 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF9O43307 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF9O43307 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF9O43307 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF9O43307 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF9O43307 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF9O43307 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF9O43307 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF9O43307 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF9O43307 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF9O43307 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF9O43307 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF9O43307 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF9O43307 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF9O43307 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF9O43307 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF9O43307 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF9O43307 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF9O43307 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF9O43307 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF9O43307 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARHGEF9O43307 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF9O43307 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF9O43307 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF9O43307 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF9O43307 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF9O43307 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF9O43307 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF9O43307 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF9O43307 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF9O43307 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF9O43307 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF9O43307 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF9O43307 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF9O43307 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF9O43307 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF9O43307 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF9O43307 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF9O43307 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF9O43307 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF9O43307 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF9O43307 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF9O43307 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF9O43307 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF9O43307 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF9O43307 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF9O43307 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF9O43307 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGEF9O43307 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGEF9O43307 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF9O43307 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF9O43307 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF9O43307 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF9O43307 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF9O43307 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms