Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
VGFO15240 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
VGFO15240 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
VGFO15240 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
VGFO15240 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
VGFO15240 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
VGFO15240 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
VGFO15240 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
VGFO15240 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
VGFO15240 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
VGFO15240 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
VGFO15240 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
VGFO15240 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
VGFO15240 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
VGFO15240 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
VGFO15240 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
VGFO15240 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
VGFO15240 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
VGFO15240 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
VGFO15240 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
VGFO15240 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
VGFO15240 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
VGFO15240 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
VGFO15240 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
VGFO15240 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
VGFO15240 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
VGFO15240 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
VGFO15240 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
VGFO15240 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.58
VGFO15240 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
VGFO15240 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
VGFO15240 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
VGFO15240 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
VGFO15240 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.38■■■■□ 3.58
VGFO15240 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
VGFO15240 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
VGFO15240 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
VGFO15240 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
VGFO15240 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
VGFO15240 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
VGFO15240 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
VGFO15240 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
VGFO15240 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.56
VGFO15240 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
VGFO15240 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
VGFO15240 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
VGFO15240 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
VGFO15240 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
VGFO15240 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
VGFO15240 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
VGFO15240 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
VGFO15240 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
VGFO15240 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
VGFO15240 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
VGFO15240 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
VGFO15240 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
VGFO15240 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
VGFO15240 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
VGFO15240 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
VGFO15240 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
VGFO15240 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
VGFO15240 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
VGFO15240 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
VGFO15240 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
VGFO15240 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
VGFO15240 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
VGFO15240 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
VGFO15240 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
VGFO15240 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
VGFO15240 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
VGFO15240 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
VGFO15240 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
VGFO15240 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
VGFO15240 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
VGFO15240 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
VGFO15240 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
VGFO15240 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
VGFO15240 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
VGFO15240 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
VGFO15240 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
VGFO15240 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
VGFO15240 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
VGFO15240 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
VGFO15240 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
VGFO15240 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
VGFO15240 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
VGFO15240 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
VGFO15240 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
VGFO15240 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
VGFO15240 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
VGFO15240 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
VGFO15240 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
VGFO15240 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
VGFO15240 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
VGFO15240 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
VGFO15240 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
VGFO15240 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
VGFO15240 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
VGFO15240 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
VGFO15240 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms