Protein–RNA interactions for Protein: O14649

KCNK3, Potassium channel subfamily K member 3, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK3O14649 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNK3O14649 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KCNK3O14649 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNK3O14649 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNK3O14649 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNK3O14649 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNK3O14649 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNK3O14649 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNK3O14649 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNK3O14649 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNK3O14649 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNK3O14649 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNK3O14649 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNK3O14649 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNK3O14649 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNK3O14649 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms