Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E2F3O00716 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
E2F3O00716 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E2F3O00716 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
E2F3O00716 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E2F3O00716 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E2F3O00716 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
E2F3O00716 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E2F3O00716 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E2F3O00716 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
E2F3O00716 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E2F3O00716 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
E2F3O00716 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
E2F3O00716 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E2F3O00716 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
E2F3O00716 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
E2F3O00716 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
E2F3O00716 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
E2F3O00716 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
E2F3O00716 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
E2F3O00716 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
E2F3O00716 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
E2F3O00716 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E2F3O00716 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
E2F3O00716 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E2F3O00716 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E2F3O00716 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E2F3O00716 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E2F3O00716 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E2F3O00716 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E2F3O00716 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E2F3O00716 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
E2F3O00716 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
E2F3O00716 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E2F3O00716 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
E2F3O00716 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
E2F3O00716 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
E2F3O00716 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
E2F3O00716 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
E2F3O00716 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
E2F3O00716 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
E2F3O00716 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
E2F3O00716 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
E2F3O00716 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
E2F3O00716 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
E2F3O00716 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
E2F3O00716 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
E2F3O00716 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
E2F3O00716 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
E2F3O00716 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
E2F3O00716 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2F3O00716 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2F3O00716 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2F3O00716 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2F3O00716 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2F3O00716 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2F3O00716 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
E2F3O00716 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E2F3O00716 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
E2F3O00716 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E2F3O00716 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E2F3O00716 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
E2F3O00716 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E2F3O00716 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
E2F3O00716 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
E2F3O00716 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
E2F3O00716 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
E2F3O00716 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
E2F3O00716 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
E2F3O00716 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E2F3O00716 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E2F3O00716 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E2F3O00716 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E2F3O00716 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E2F3O00716 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E2F3O00716 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E2F3O00716 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E2F3O00716 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
E2F3O00716 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
E2F3O00716 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
E2F3O00716 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
E2F3O00716 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
E2F3O00716 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
E2F3O00716 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
E2F3O00716 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
E2F3O00716 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
E2F3O00716 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
E2F3O00716 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
E2F3O00716 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
E2F3O00716 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
E2F3O00716 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
E2F3O00716 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
E2F3O00716 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F3O00716 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F3O00716 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
E2F3O00716 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
E2F3O00716 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
E2F3O00716 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
E2F3O00716 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
E2F3O00716 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms