Protein–RNA interactions for Protein: O00341

SLC1A7, Excitatory amino acid transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A7O00341 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A7O00341 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A7O00341 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A7O00341 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A7O00341 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A7O00341 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A7O00341 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A7O00341 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A7O00341 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A7O00341 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A7O00341 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A7O00341 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A7O00341 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A7O00341 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A7O00341 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A7O00341 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A7O00341 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A7O00341 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A7O00341 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A7O00341 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A7O00341 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A7O00341 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A7O00341 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A7O00341 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A7O00341 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A7O00341 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A7O00341 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A7O00341 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A7O00341 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A7O00341 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A7O00341 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A7O00341 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A7O00341 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A7O00341 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A7O00341 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A7O00341 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A7O00341 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A7O00341 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A7O00341 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A7O00341 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A7O00341 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A7O00341 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A7O00341 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A7O00341 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A7O00341 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A7O00341 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A7O00341 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC1A7O00341 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC1A7O00341 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A7O00341 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A7O00341 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A7O00341 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A7O00341 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A7O00341 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A7O00341 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A7O00341 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A7O00341 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A7O00341 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A7O00341 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A7O00341 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A7O00341 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A7O00341 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A7O00341 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A7O00341 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A7O00341 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A7O00341 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A7O00341 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A7O00341 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A7O00341 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A7O00341 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A7O00341 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A7O00341 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A7O00341 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A7O00341 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A7O00341 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A7O00341 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A7O00341 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A7O00341 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A7O00341 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A7O00341 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A7O00341 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A7O00341 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A7O00341 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A7O00341 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A7O00341 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A7O00341 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A7O00341 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A7O00341 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A7O00341 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A7O00341 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A7O00341 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A7O00341 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A7O00341 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A7O00341 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A7O00341 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A7O00341 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC1A7O00341 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC1A7O00341 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC1A7O00341 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC1A7O00341 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms