Protein–RNA interactions for Protein: O00299

CLIC1, Chloride intracellular channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC1O00299 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLIC1O00299 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLIC1O00299 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLIC1O00299 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLIC1O00299 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLIC1O00299 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLIC1O00299 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLIC1O00299 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLIC1O00299 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLIC1O00299 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLIC1O00299 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLIC1O00299 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLIC1O00299 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIC1O00299 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIC1O00299 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIC1O00299 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIC1O00299 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIC1O00299 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLIC1O00299 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLIC1O00299 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLIC1O00299 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLIC1O00299 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLIC1O00299 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLIC1O00299 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CLIC1O00299 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLIC1O00299 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIC1O00299 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIC1O00299 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIC1O00299 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLIC1O00299 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CLIC1O00299 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC1O00299 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC1O00299 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC1O00299 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC1O00299 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC1O00299 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC1O00299 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC1O00299 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC1O00299 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC1O00299 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC1O00299 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC1O00299 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC1O00299 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC1O00299 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC1O00299 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIC1O00299 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIC1O00299 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIC1O00299 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC1O00299 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC1O00299 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC1O00299 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC1O00299 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIC1O00299 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIC1O00299 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIC1O00299 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIC1O00299 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC1O00299 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC1O00299 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC1O00299 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC1O00299 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC1O00299 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC1O00299 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC1O00299 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIC1O00299 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171 ms