Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMAPO00193 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMAPO00193 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMAPO00193 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMAPO00193 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMAPO00193 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMAPO00193 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMAPO00193 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMAPO00193 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMAPO00193 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMAPO00193 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMAPO00193 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMAPO00193 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMAPO00193 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMAPO00193 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMAPO00193 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMAPO00193 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMAPO00193 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMAPO00193 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMAPO00193 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMAPO00193 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMAPO00193 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMAPO00193 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMAPO00193 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMAPO00193 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SMAPO00193 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMAPO00193 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMAPO00193 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMAPO00193 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMAPO00193 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMAPO00193 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMAPO00193 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMAPO00193 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMAPO00193 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMAPO00193 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMAPO00193 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMAPO00193 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMAPO00193 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMAPO00193 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMAPO00193 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMAPO00193 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMAPO00193 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMAPO00193 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SMAPO00193 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMAPO00193 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMAPO00193 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMAPO00193 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMAPO00193 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMAPO00193 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMAPO00193 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMAPO00193 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMAPO00193 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SMAPO00193 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMAPO00193 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMAPO00193 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SMAPO00193 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMAPO00193 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMAPO00193 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SMAPO00193 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMAPO00193 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMAPO00193 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMAPO00193 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMAPO00193 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMAPO00193 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SMAPO00193 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMAPO00193 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMAPO00193 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMAPO00193 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMAPO00193 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMAPO00193 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMAPO00193 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMAPO00193 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMAPO00193 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMAPO00193 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMAPO00193 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMAPO00193 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMAPO00193 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMAPO00193 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMAPO00193 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMAPO00193 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMAPO00193 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMAPO00193 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMAPO00193 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMAPO00193 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMAPO00193 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMAPO00193 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SMAPO00193 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMAPO00193 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMAPO00193 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMAPO00193 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMAPO00193 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMAPO00193 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMAPO00193 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMAPO00193 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMAPO00193 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMAPO00193 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMAPO00193 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMAPO00193 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMAPO00193 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMAPO00193 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms