Protein–RNA interactions for Protein: B7U540

KCNJ18, Inward rectifier potassium channel 18, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ18B7U540 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNJ18B7U540 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNJ18B7U540 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNJ18B7U540 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNJ18B7U540 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNJ18B7U540 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNJ18B7U540 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNJ18B7U540 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNJ18B7U540 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNJ18B7U540 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNJ18B7U540 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNJ18B7U540 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNJ18B7U540 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNJ18B7U540 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNJ18B7U540 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNJ18B7U540 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNJ18B7U540 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNJ18B7U540 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNJ18B7U540 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNJ18B7U540 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNJ18B7U540 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNJ18B7U540 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNJ18B7U540 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNJ18B7U540 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNJ18B7U540 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNJ18B7U540 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNJ18B7U540 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNJ18B7U540 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNJ18B7U540 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNJ18B7U540 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNJ18B7U540 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNJ18B7U540 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNJ18B7U540 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNJ18B7U540 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNJ18B7U540 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNJ18B7U540 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNJ18B7U540 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNJ18B7U540 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNJ18B7U540 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNJ18B7U540 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNJ18B7U540 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNJ18B7U540 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNJ18B7U540 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KCNJ18B7U540 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNJ18B7U540 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNJ18B7U540 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNJ18B7U540 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNJ18B7U540 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNJ18B7U540 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNJ18B7U540 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNJ18B7U540 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNJ18B7U540 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNJ18B7U540 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNJ18B7U540 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNJ18B7U540 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNJ18B7U540 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNJ18B7U540 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNJ18B7U540 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNJ18B7U540 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNJ18B7U540 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNJ18B7U540 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNJ18B7U540 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNJ18B7U540 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNJ18B7U540 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNJ18B7U540 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNJ18B7U540 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNJ18B7U540 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNJ18B7U540 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNJ18B7U540 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNJ18B7U540 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNJ18B7U540 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNJ18B7U540 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNJ18B7U540 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNJ18B7U540 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNJ18B7U540 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNJ18B7U540 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNJ18B7U540 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNJ18B7U540 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNJ18B7U540 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNJ18B7U540 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNJ18B7U540 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNJ18B7U540 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNJ18B7U540 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNJ18B7U540 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNJ18B7U540 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNJ18B7U540 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNJ18B7U540 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNJ18B7U540 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNJ18B7U540 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNJ18B7U540 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNJ18B7U540 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNJ18B7U540 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNJ18B7U540 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNJ18B7U540 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNJ18B7U540 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNJ18B7U540 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNJ18B7U540 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNJ18B7U540 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNJ18B7U540 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNJ18B7U540 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms