Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
B4DEV8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
B4DEV8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
B4DEV8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
B4DEV8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
B4DEV8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
B4DEV8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
B4DEV8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
B4DEV8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
B4DEV8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
B4DEV8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
B4DEV8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
B4DEV8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
B4DEV8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
B4DEV8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
B4DEV8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
B4DEV8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
B4DEV8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
B4DEV8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
B4DEV8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
B4DEV8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
B4DEV8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
B4DEV8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
B4DEV8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
B4DEV8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
B4DEV8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
B4DEV8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
B4DEV8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
B4DEV8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
B4DEV8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
B4DEV8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
B4DEV8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
B4DEV8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
B4DEV8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
B4DEV8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
B4DEV8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
B4DEV8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
B4DEV8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
B4DEV8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
B4DEV8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
B4DEV8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
B4DEV8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
B4DEV8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
B4DEV8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
B4DEV8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
B4DEV8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
B4DEV8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DEV8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DEV8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4DEV8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DEV8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DEV8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DEV8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DEV8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DEV8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DEV8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DEV8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DEV8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DEV8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DEV8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DEV8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DEV8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DEV8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DEV8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DEV8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DEV8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DEV8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DEV8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DEV8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DEV8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DEV8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DEV8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DEV8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DEV8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DEV8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DEV8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DEV8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DEV8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DEV8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DEV8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
B4DEV8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
B4DEV8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DEV8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DEV8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DEV8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DEV8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DEV8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DEV8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DEV8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DEV8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DEV8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DEV8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DEV8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DEV8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DEV8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DEV8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
B4DEV8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
B4DEV8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
B4DEV8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
B4DEV8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms