Protein–RNA interactions for Protein: A8K7I4

CLCA1, Calcium-activated chloride channel regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA1A8K7I4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCA1A8K7I4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCA1A8K7I4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCA1A8K7I4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCA1A8K7I4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCA1A8K7I4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCA1A8K7I4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCA1A8K7I4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCA1A8K7I4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCA1A8K7I4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCA1A8K7I4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCA1A8K7I4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCA1A8K7I4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCA1A8K7I4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCA1A8K7I4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CLCA1A8K7I4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCA1A8K7I4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCA1A8K7I4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCA1A8K7I4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCA1A8K7I4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLCA1A8K7I4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLCA1A8K7I4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLCA1A8K7I4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLCA1A8K7I4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCA1A8K7I4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCA1A8K7I4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCA1A8K7I4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCA1A8K7I4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLCA1A8K7I4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLCA1A8K7I4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLCA1A8K7I4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLCA1A8K7I4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLCA1A8K7I4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLCA1A8K7I4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCA1A8K7I4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCA1A8K7I4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCA1A8K7I4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCA1A8K7I4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCA1A8K7I4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCA1A8K7I4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCA1A8K7I4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCA1A8K7I4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCA1A8K7I4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLCA1A8K7I4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLCA1A8K7I4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLCA1A8K7I4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLCA1A8K7I4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLCA1A8K7I4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLCA1A8K7I4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCA1A8K7I4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCA1A8K7I4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCA1A8K7I4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCA1A8K7I4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCA1A8K7I4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLCA1A8K7I4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLCA1A8K7I4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLCA1A8K7I4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLCA1A8K7I4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLCA1A8K7I4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCA1A8K7I4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCA1A8K7I4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCA1A8K7I4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCA1A8K7I4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCA1A8K7I4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCA1A8K7I4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLCA1A8K7I4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLCA1A8K7I4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms