Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KNCNA6PVL3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KNCNA6PVL3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KNCNA6PVL3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KNCNA6PVL3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KNCNA6PVL3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNCNA6PVL3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNCNA6PVL3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNCNA6PVL3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
KNCNA6PVL3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNCNA6PVL3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNCNA6PVL3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNCNA6PVL3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KNCNA6PVL3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KNCNA6PVL3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KNCNA6PVL3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KNCNA6PVL3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KNCNA6PVL3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KNCNA6PVL3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNCNA6PVL3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNCNA6PVL3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNCNA6PVL3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KNCNA6PVL3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KNCNA6PVL3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KNCNA6PVL3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNCNA6PVL3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNCNA6PVL3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNCNA6PVL3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KNCNA6PVL3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KNCNA6PVL3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KNCNA6PVL3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KNCNA6PVL3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KNCNA6PVL3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNCNA6PVL3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNCNA6PVL3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNCNA6PVL3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNCNA6PVL3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNCNA6PVL3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
KNCNA6PVL3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KNCNA6PVL3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KNCNA6PVL3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KNCNA6PVL3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KNCNA6PVL3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KNCNA6PVL3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KNCNA6PVL3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KNCNA6PVL3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KNCNA6PVL3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KNCNA6PVL3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KNCNA6PVL3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KNCNA6PVL3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KNCNA6PVL3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KNCNA6PVL3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KNCNA6PVL3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KNCNA6PVL3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KNCNA6PVL3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KNCNA6PVL3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KNCNA6PVL3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KNCNA6PVL3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNCNA6PVL3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNCNA6PVL3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNCNA6PVL3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNCNA6PVL3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KNCNA6PVL3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KNCNA6PVL3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KNCNA6PVL3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KNCNA6PVL3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KNCNA6PVL3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KNCNA6PVL3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KNCNA6PVL3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNCNA6PVL3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNCNA6PVL3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNCNA6PVL3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNCNA6PVL3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNCNA6PVL3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNCNA6PVL3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNCNA6PVL3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KNCNA6PVL3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNCNA6PVL3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNCNA6PVL3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNCNA6PVL3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KNCNA6PVL3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KNCNA6PVL3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KNCNA6PVL3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KNCNA6PVL3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KNCNA6PVL3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KNCNA6PVL3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms