Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP27XA6NNY8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP27XA6NNY8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP27XA6NNY8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP27XA6NNY8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP27XA6NNY8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP27XA6NNY8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP27XA6NNY8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
USP27XA6NNY8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP27XA6NNY8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP27XA6NNY8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP27XA6NNY8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP27XA6NNY8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP27XA6NNY8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP27XA6NNY8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP27XA6NNY8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP27XA6NNY8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP27XA6NNY8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP27XA6NNY8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP27XA6NNY8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP27XA6NNY8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
USP27XA6NNY8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP27XA6NNY8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP27XA6NNY8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP27XA6NNY8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP27XA6NNY8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP27XA6NNY8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP27XA6NNY8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP27XA6NNY8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
USP27XA6NNY8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP27XA6NNY8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP27XA6NNY8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP27XA6NNY8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP27XA6NNY8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP27XA6NNY8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP27XA6NNY8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP27XA6NNY8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP27XA6NNY8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP27XA6NNY8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP27XA6NNY8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP27XA6NNY8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP27XA6NNY8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP27XA6NNY8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
USP27XA6NNY8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP27XA6NNY8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP27XA6NNY8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP27XA6NNY8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP27XA6NNY8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP27XA6NNY8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP27XA6NNY8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
USP27XA6NNY8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP27XA6NNY8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP27XA6NNY8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP27XA6NNY8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP27XA6NNY8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP27XA6NNY8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP27XA6NNY8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP27XA6NNY8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP27XA6NNY8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP27XA6NNY8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP27XA6NNY8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP27XA6NNY8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP27XA6NNY8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP27XA6NNY8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP27XA6NNY8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
USP27XA6NNY8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP27XA6NNY8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP27XA6NNY8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP27XA6NNY8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP27XA6NNY8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
USP27XA6NNY8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP27XA6NNY8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP27XA6NNY8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP27XA6NNY8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP27XA6NNY8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP27XA6NNY8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP27XA6NNY8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP27XA6NNY8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP27XA6NNY8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP27XA6NNY8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP27XA6NNY8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP27XA6NNY8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP27XA6NNY8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP27XA6NNY8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP27XA6NNY8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP27XA6NNY8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
USP27XA6NNY8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP27XA6NNY8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP27XA6NNY8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP27XA6NNY8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
USP27XA6NNY8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP27XA6NNY8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP27XA6NNY8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP27XA6NNY8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP27XA6NNY8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
USP27XA6NNY8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP27XA6NNY8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP27XA6NNY8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP27XA6NNY8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP27XA6NNY8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms