Protein–RNA interactions for Protein: A6NFA1

TRABD2B, Metalloprotease TIKI2, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABD2BA6NFA1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRABD2BA6NFA1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRABD2BA6NFA1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRABD2BA6NFA1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRABD2BA6NFA1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRABD2BA6NFA1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRABD2BA6NFA1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRABD2BA6NFA1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRABD2BA6NFA1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRABD2BA6NFA1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRABD2BA6NFA1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRABD2BA6NFA1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRABD2BA6NFA1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRABD2BA6NFA1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRABD2BA6NFA1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRABD2BA6NFA1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRABD2BA6NFA1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRABD2BA6NFA1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRABD2BA6NFA1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRABD2BA6NFA1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRABD2BA6NFA1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRABD2BA6NFA1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRABD2BA6NFA1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRABD2BA6NFA1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRABD2BA6NFA1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRABD2BA6NFA1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRABD2BA6NFA1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRABD2BA6NFA1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRABD2BA6NFA1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRABD2BA6NFA1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRABD2BA6NFA1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRABD2BA6NFA1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRABD2BA6NFA1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRABD2BA6NFA1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRABD2BA6NFA1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRABD2BA6NFA1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRABD2BA6NFA1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRABD2BA6NFA1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRABD2BA6NFA1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRABD2BA6NFA1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRABD2BA6NFA1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRABD2BA6NFA1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRABD2BA6NFA1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRABD2BA6NFA1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRABD2BA6NFA1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRABD2BA6NFA1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRABD2BA6NFA1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRABD2BA6NFA1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRABD2BA6NFA1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRABD2BA6NFA1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRABD2BA6NFA1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRABD2BA6NFA1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRABD2BA6NFA1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRABD2BA6NFA1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRABD2BA6NFA1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRABD2BA6NFA1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRABD2BA6NFA1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRABD2BA6NFA1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRABD2BA6NFA1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRABD2BA6NFA1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRABD2BA6NFA1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRABD2BA6NFA1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRABD2BA6NFA1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRABD2BA6NFA1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRABD2BA6NFA1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRABD2BA6NFA1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRABD2BA6NFA1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRABD2BA6NFA1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRABD2BA6NFA1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRABD2BA6NFA1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRABD2BA6NFA1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRABD2BA6NFA1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRABD2BA6NFA1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRABD2BA6NFA1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRABD2BA6NFA1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRABD2BA6NFA1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRABD2BA6NFA1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRABD2BA6NFA1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TRABD2BA6NFA1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRABD2BA6NFA1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRABD2BA6NFA1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRABD2BA6NFA1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRABD2BA6NFA1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRABD2BA6NFA1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRABD2BA6NFA1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRABD2BA6NFA1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRABD2BA6NFA1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRABD2BA6NFA1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRABD2BA6NFA1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRABD2BA6NFA1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRABD2BA6NFA1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRABD2BA6NFA1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRABD2BA6NFA1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRABD2BA6NFA1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRABD2BA6NFA1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRABD2BA6NFA1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRABD2BA6NFA1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRABD2BA6NFA1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRABD2BA6NFA1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRABD2BA6NFA1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms