Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C5orf51A6NDU8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C5orf51A6NDU8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C5orf51A6NDU8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C5orf51A6NDU8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C5orf51A6NDU8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C5orf51A6NDU8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C5orf51A6NDU8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf51A6NDU8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf51A6NDU8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C5orf51A6NDU8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C5orf51A6NDU8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C5orf51A6NDU8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C5orf51A6NDU8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C5orf51A6NDU8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C5orf51A6NDU8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C5orf51A6NDU8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf51A6NDU8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf51A6NDU8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf51A6NDU8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf51A6NDU8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf51A6NDU8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C5orf51A6NDU8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C5orf51A6NDU8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C5orf51A6NDU8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C5orf51A6NDU8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C5orf51A6NDU8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C5orf51A6NDU8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C5orf51A6NDU8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C5orf51A6NDU8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C5orf51A6NDU8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C5orf51A6NDU8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C5orf51A6NDU8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C5orf51A6NDU8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C5orf51A6NDU8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C5orf51A6NDU8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C5orf51A6NDU8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C5orf51A6NDU8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C5orf51A6NDU8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C5orf51A6NDU8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C5orf51A6NDU8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C5orf51A6NDU8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C5orf51A6NDU8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C5orf51A6NDU8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C5orf51A6NDU8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C5orf51A6NDU8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C5orf51A6NDU8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C5orf51A6NDU8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C5orf51A6NDU8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C5orf51A6NDU8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C5orf51A6NDU8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C5orf51A6NDU8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C5orf51A6NDU8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C5orf51A6NDU8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C5orf51A6NDU8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C5orf51A6NDU8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C5orf51A6NDU8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C5orf51A6NDU8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C5orf51A6NDU8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C5orf51A6NDU8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C5orf51A6NDU8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C5orf51A6NDU8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf51A6NDU8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf51A6NDU8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf51A6NDU8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf51A6NDU8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf51A6NDU8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf51A6NDU8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf51A6NDU8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf51A6NDU8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf51A6NDU8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf51A6NDU8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C5orf51A6NDU8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C5orf51A6NDU8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C5orf51A6NDU8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf51A6NDU8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf51A6NDU8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf51A6NDU8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf51A6NDU8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf51A6NDU8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf51A6NDU8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf51A6NDU8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf51A6NDU8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf51A6NDU8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf51A6NDU8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf51A6NDU8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf51A6NDU8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf51A6NDU8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf51A6NDU8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf51A6NDU8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf51A6NDU8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf51A6NDU8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf51A6NDU8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C5orf51A6NDU8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C5orf51A6NDU8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C5orf51A6NDU8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C5orf51A6NDU8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C5orf51A6NDU8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C5orf51A6NDU8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C5orf51A6NDU8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.5 ms