Protein–RNA interactions for Protein: A6NDI0

TRIM49B, Putative tripartite motif-containing protein 49B, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49BA6NDI0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM49BA6NDI0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM49BA6NDI0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM49BA6NDI0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM49BA6NDI0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM49BA6NDI0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM49BA6NDI0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM49BA6NDI0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM49BA6NDI0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM49BA6NDI0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM49BA6NDI0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM49BA6NDI0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM49BA6NDI0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM49BA6NDI0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM49BA6NDI0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM49BA6NDI0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM49BA6NDI0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM49BA6NDI0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM49BA6NDI0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM49BA6NDI0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM49BA6NDI0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM49BA6NDI0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM49BA6NDI0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM49BA6NDI0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM49BA6NDI0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM49BA6NDI0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM49BA6NDI0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM49BA6NDI0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM49BA6NDI0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM49BA6NDI0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM49BA6NDI0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM49BA6NDI0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM49BA6NDI0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM49BA6NDI0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM49BA6NDI0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM49BA6NDI0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM49BA6NDI0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM49BA6NDI0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM49BA6NDI0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM49BA6NDI0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM49BA6NDI0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM49BA6NDI0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM49BA6NDI0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM49BA6NDI0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM49BA6NDI0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM49BA6NDI0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM49BA6NDI0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM49BA6NDI0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM49BA6NDI0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM49BA6NDI0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM49BA6NDI0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM49BA6NDI0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM49BA6NDI0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TRIM49BA6NDI0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM49BA6NDI0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM49BA6NDI0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM49BA6NDI0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM49BA6NDI0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM49BA6NDI0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM49BA6NDI0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM49BA6NDI0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM49BA6NDI0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM49BA6NDI0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM49BA6NDI0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM49BA6NDI0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM49BA6NDI0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM49BA6NDI0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM49BA6NDI0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM49BA6NDI0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM49BA6NDI0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM49BA6NDI0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM49BA6NDI0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM49BA6NDI0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM49BA6NDI0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM49BA6NDI0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM49BA6NDI0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM49BA6NDI0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM49BA6NDI0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM49BA6NDI0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM49BA6NDI0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM49BA6NDI0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM49BA6NDI0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM49BA6NDI0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM49BA6NDI0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM49BA6NDI0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM49BA6NDI0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM49BA6NDI0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM49BA6NDI0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM49BA6NDI0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM49BA6NDI0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM49BA6NDI0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM49BA6NDI0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM49BA6NDI0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM49BA6NDI0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM49BA6NDI0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM49BA6NDI0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM49BA6NDI0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM49BA6NDI0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM49BA6NDI0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM49BA6NDI0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms