Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4D1N5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A4D1N5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A4D1N5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4D1N5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
A4D1N5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4D1N5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4D1N5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4D1N5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A4D1N5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
A4D1N5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
A4D1N5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
A4D1N5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4D1N5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4D1N5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4D1N5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4D1N5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4D1N5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4D1N5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4D1N5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4D1N5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4D1N5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4D1N5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4D1N5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4D1N5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4D1N5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4D1N5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4D1N5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4D1N5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4D1N5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4D1N5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4D1N5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A4D1N5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A4D1N5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
A4D1N5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4D1N5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A4D1N5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A4D1N5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A4D1N5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A4D1N5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A4D1N5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A4D1N5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A4D1N5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A4D1N5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A4D1N5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A4D1N5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A4D1N5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A4D1N5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A4D1N5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A4D1N5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A4D1N5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A4D1N5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A4D1N5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
A4D1N5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A4D1N5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A4D1N5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A4D1N5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A4D1N5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A4D1N5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A4D1N5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A4D1N5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4D1N5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4D1N5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A4D1N5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
A4D1N5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
A4D1N5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A4D1N5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
A4D1N5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
A4D1N5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A4D1N5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
A4D1N5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4D1N5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4D1N5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A4D1N5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A4D1N5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A4D1N5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A4D1N5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A4D1N5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A4D1N5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A4D1N5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A4D1N5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A4D1N5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A4D1N5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A4D1N5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
A4D1N5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A4D1N5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A4D1N5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A4D1N5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
A4D1N5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
A4D1N5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
A4D1N5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
A4D1N5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
A4D1N5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
A4D1N5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
A4D1N5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
A4D1N5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
A4D1N5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
A4D1N5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
A4D1N5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
A4D1N5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms