Protein–RNA interactions for Protein: A0A5B9

TRBC2, T-cell receptor beta-2 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC2A0A5B9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRBC2A0A5B9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRBC2A0A5B9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRBC2A0A5B9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRBC2A0A5B9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRBC2A0A5B9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRBC2A0A5B9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRBC2A0A5B9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRBC2A0A5B9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRBC2A0A5B9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRBC2A0A5B9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRBC2A0A5B9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRBC2A0A5B9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRBC2A0A5B9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRBC2A0A5B9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRBC2A0A5B9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRBC2A0A5B9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRBC2A0A5B9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRBC2A0A5B9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRBC2A0A5B9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRBC2A0A5B9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRBC2A0A5B9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRBC2A0A5B9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRBC2A0A5B9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRBC2A0A5B9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRBC2A0A5B9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRBC2A0A5B9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRBC2A0A5B9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRBC2A0A5B9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRBC2A0A5B9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRBC2A0A5B9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRBC2A0A5B9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRBC2A0A5B9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRBC2A0A5B9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRBC2A0A5B9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRBC2A0A5B9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRBC2A0A5B9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRBC2A0A5B9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRBC2A0A5B9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRBC2A0A5B9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBC2A0A5B9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBC2A0A5B9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBC2A0A5B9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRBC2A0A5B9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRBC2A0A5B9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRBC2A0A5B9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRBC2A0A5B9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRBC2A0A5B9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRBC2A0A5B9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRBC2A0A5B9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRBC2A0A5B9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRBC2A0A5B9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRBC2A0A5B9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRBC2A0A5B9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRBC2A0A5B9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRBC2A0A5B9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRBC2A0A5B9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRBC2A0A5B9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRBC2A0A5B9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRBC2A0A5B9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRBC2A0A5B9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRBC2A0A5B9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRBC2A0A5B9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRBC2A0A5B9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRBC2A0A5B9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRBC2A0A5B9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRBC2A0A5B9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRBC2A0A5B9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRBC2A0A5B9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRBC2A0A5B9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRBC2A0A5B9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRBC2A0A5B9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRBC2A0A5B9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRBC2A0A5B9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRBC2A0A5B9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRBC2A0A5B9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRBC2A0A5B9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRBC2A0A5B9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRBC2A0A5B9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRBC2A0A5B9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRBC2A0A5B9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRBC2A0A5B9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRBC2A0A5B9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRBC2A0A5B9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRBC2A0A5B9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRBC2A0A5B9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRBC2A0A5B9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRBC2A0A5B9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRBC2A0A5B9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRBC2A0A5B9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRBC2A0A5B9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRBC2A0A5B9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRBC2A0A5B9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRBC2A0A5B9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRBC2A0A5B9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRBC2A0A5B9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRBC2A0A5B9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRBC2A0A5B9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRBC2A0A5B9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRBC2A0A5B9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms