Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTI1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTI1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1B0GTI1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1B0GTI1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1B0GTI1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1B0GTI1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1B0GTI1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1B0GTI1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1B0GTI1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1B0GTI1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1B0GTI1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1B0GTI1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1B0GTI1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GTI1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GTI1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GTI1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GTI1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GTI1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GTI1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GTI1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GTI1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1B0GTI1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1B0GTI1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1B0GTI1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1B0GTI1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1B0GTI1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
A0A1B0GTI1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GTI1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GTI1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GTI1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GTI1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GTI1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GTI1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1B0GTI1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GTI1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GTI1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GTI1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GTI1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GTI1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GTI1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GTI1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTI1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTI1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTI1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTI1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTI1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTI1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GTI1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GTI1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GTI1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GTI1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GTI1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A1B0GTI1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A1B0GTI1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GTI1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GTI1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GTI1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GTI1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GTI1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GTI1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GTI1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GTI1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GTI1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GTI1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GTI1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GTI1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GTI1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GTI1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GTI1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GTI1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GTI1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GTI1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GTI1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GTI1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GTI1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GTI1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GTI1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A1B0GTI1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A1B0GTI1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTI1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTI1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTI1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTI1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTI1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTI1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTI1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTI1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTI1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTI1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTI1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTI1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTI1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GTI1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GTI1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GTI1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GTI1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GTI1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GTI1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1B0GTI1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1B0GTI1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1B0GTI1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms