Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS06

TRBV23-1, T-cell receptor beta variable 23-1 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV23-1A0A0A0MS06 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV23-1A0A0A0MS06 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV23-1A0A0A0MS06 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV23-1A0A0A0MS06 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV23-1A0A0A0MS06 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV23-1A0A0A0MS06 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV23-1A0A0A0MS06 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV23-1A0A0A0MS06 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV23-1A0A0A0MS06 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV23-1A0A0A0MS06 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV23-1A0A0A0MS06 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV23-1A0A0A0MS06 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV23-1A0A0A0MS06 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV23-1A0A0A0MS06 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV23-1A0A0A0MS06 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV23-1A0A0A0MS06 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV23-1A0A0A0MS06 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV23-1A0A0A0MS06 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV23-1A0A0A0MS06 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV23-1A0A0A0MS06 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV23-1A0A0A0MS06 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV23-1A0A0A0MS06 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV23-1A0A0A0MS06 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV23-1A0A0A0MS06 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV23-1A0A0A0MS06 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRBV23-1A0A0A0MS06 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV23-1A0A0A0MS06 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV23-1A0A0A0MS06 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV23-1A0A0A0MS06 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV23-1A0A0A0MS06 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV23-1A0A0A0MS06 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV23-1A0A0A0MS06 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV23-1A0A0A0MS06 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV23-1A0A0A0MS06 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV23-1A0A0A0MS06 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV23-1A0A0A0MS06 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV23-1A0A0A0MS06 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV23-1A0A0A0MS06 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV23-1A0A0A0MS06 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV23-1A0A0A0MS06 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV23-1A0A0A0MS06 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV23-1A0A0A0MS06 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV23-1A0A0A0MS06 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV23-1A0A0A0MS06 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV23-1A0A0A0MS06 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV23-1A0A0A0MS06 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV23-1A0A0A0MS06 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV23-1A0A0A0MS06 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV23-1A0A0A0MS06 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV23-1A0A0A0MS06 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV23-1A0A0A0MS06 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV23-1A0A0A0MS06 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV23-1A0A0A0MS06 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV23-1A0A0A0MS06 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV23-1A0A0A0MS06 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV23-1A0A0A0MS06 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV23-1A0A0A0MS06 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV23-1A0A0A0MS06 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV23-1A0A0A0MS06 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV23-1A0A0A0MS06 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV23-1A0A0A0MS06 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV23-1A0A0A0MS06 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV23-1A0A0A0MS06 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV23-1A0A0A0MS06 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV23-1A0A0A0MS06 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV23-1A0A0A0MS06 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV23-1A0A0A0MS06 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV23-1A0A0A0MS06 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV23-1A0A0A0MS06 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV23-1A0A0A0MS06 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV23-1A0A0A0MS06 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV23-1A0A0A0MS06 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV23-1A0A0A0MS06 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV23-1A0A0A0MS06 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV23-1A0A0A0MS06 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV23-1A0A0A0MS06 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV23-1A0A0A0MS06 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV23-1A0A0A0MS06 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV23-1A0A0A0MS06 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV23-1A0A0A0MS06 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV23-1A0A0A0MS06 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV23-1A0A0A0MS06 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV23-1A0A0A0MS06 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV23-1A0A0A0MS06 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV23-1A0A0A0MS06 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV23-1A0A0A0MS06 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV23-1A0A0A0MS06 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV23-1A0A0A0MS06 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV23-1A0A0A0MS06 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV23-1A0A0A0MS06 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV23-1A0A0A0MS06 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV23-1A0A0A0MS06 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV23-1A0A0A0MS06 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV23-1A0A0A0MS06 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV23-1A0A0A0MS06 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms