Protein–RNA interactions for Protein: A0A088AWK7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A088AWK7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A088AWK7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A088AWK7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A088AWK7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A088AWK7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms