Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GIT1Q9Y2X7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GIT1Q9Y2X7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GIT1Q9Y2X7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GIT1Q9Y2X7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GIT1Q9Y2X7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GIT1Q9Y2X7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GIT1Q9Y2X7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GIT1Q9Y2X7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GIT1Q9Y2X7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GIT1Q9Y2X7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GIT1Q9Y2X7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GIT1Q9Y2X7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GIT1Q9Y2X7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GIT1Q9Y2X7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GIT1Q9Y2X7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GIT1Q9Y2X7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GIT1Q9Y2X7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GIT1Q9Y2X7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GIT1Q9Y2X7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GIT1Q9Y2X7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GIT1Q9Y2X7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GIT1Q9Y2X7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GIT1Q9Y2X7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GIT1Q9Y2X7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GIT1Q9Y2X7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GIT1Q9Y2X7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GIT1Q9Y2X7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GIT1Q9Y2X7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GIT1Q9Y2X7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms