Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms