Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC41.13■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC41.13■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC41.12■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC41.09■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC41.07■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
CCDC180Q9P1Z9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC41.07■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms