Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMSN1Q9NSI8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms