Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRDM5Q9NQX1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM5Q9NQX1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM5Q9NQX1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM5Q9NQX1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM5Q9NQX1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM5Q9NQX1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM5Q9NQX1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM5Q9NQX1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM5Q9NQX1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM5Q9NQX1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM5Q9NQX1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM5Q9NQX1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM5Q9NQX1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM5Q9NQX1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM5Q9NQX1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM5Q9NQX1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM5Q9NQX1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM5Q9NQX1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM5Q9NQX1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM5Q9NQX1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM5Q9NQX1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM5Q9NQX1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM5Q9NQX1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM5Q9NQX1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM5Q9NQX1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM5Q9NQX1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM5Q9NQX1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM5Q9NQX1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms