Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC52A3Q9NQ40 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms