Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ROPN1BQ9BZX4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ROPN1BQ9BZX4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms