Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT23

LIMD2, LIM domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD2Q9BT23 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
LIMD2Q9BT23 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LIMD2Q9BT23 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LIMD2Q9BT23 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
LIMD2Q9BT23 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms