Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC136Q96JN2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms