Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCC11Q96J66 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC11Q96J66 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC11Q96J66 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms