Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPFIBP1Q86W92 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIBP1Q86W92 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms