Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM72Q6ZMU5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms