Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAPCD1Q5SSQ6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms