Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN4Q5BKX8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAVIN4Q5BKX8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms