Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL12Q53G59 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms