Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms