Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms