Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 EZR-201ENST00000337147 3068 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.583e-8■□□□□ 9
TRA2AQ13595 EZR-203ENST00000392177 2933 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.773e-8■□□□□ 9
TRA2AQ13595 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.322e-22■□□□□ 9
TRA2AQ13595 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.86□□□□□ -2.272e-22■□□□□ 9
TRA2AQ13595 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.19□□□□□ -2.225e-63■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.661e-8■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.521e-8■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.155e-6■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 RPL35-205ENST00000495728 649 ntTSL 215.83■□□□□ 0.121e-8■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.131e-8■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.385e-6■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.55e-6■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 THAP9-AS1-207ENST00000507660 550 ntTSL 39.92□□□□□ -0.821e-8■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 GPBP1L1-202ENST00000355105 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.855e-6■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 THAP9-AS1-212ENST00000513581 683 ntTSL 29.58□□□□□ -0.881e-8■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 GPBP1L1-214ENST00000498128 559 ntTSL 39.46□□□□□ -0.95e-6■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 AFDN-217ENST00000507679 670 ntTSL 37.76□□□□□ -1.175e-6■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 GPBP1L1-201ENST00000290795 3599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.255e-6■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 GPBP1L1-213ENST00000496278 1529 ntTSL 27.07□□□□□ -1.285e-6■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 THAP9-AS1-206ENST00000505028 552 ntTSL 46.78□□□□□ -1.321e-8■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 THAP9-AS1-203ENST00000504718 573 ntTSL 46.52□□□□□ -1.371e-8■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 CCDC93-206ENST00000470650 282 ntTSL 35.41□□□□□ -1.545e-6■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 SNRPF-202ENST00000549580 757 ntTSL 23.76□□□□□ -1.815e-6■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 RRBP1-209ENST00000495501 832 ntTSL 519.97■□□□□ 0.791e-6■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 RPL35-203ENST00000487431 785 ntTSL 1 (best)21.31■■□□□ 16e-9■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.136e-9■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 RPL35-204ENST00000493018 692 ntTSL 312.89□□□□□ -0.356e-9■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 RPL35-202ENST00000373570 493 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.956e-9■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.99□□□□□ -1.936e-30■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 TIMELESS-203ENST00000553532 5121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.788e-10■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 TIMELESS-201ENST00000229201 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.988e-10■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 TIMELESS-205ENST00000557589 2784 ntTSL 28.93□□□□□ -0.988e-10■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 TIMELESS-202ENST00000553314 511 ntTSL 37.37□□□□□ -1.238e-10■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 PROC-208ENST00000442644 600 ntTSL 319.54■□□□□ 0.728e-15■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.143e-11■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.183e-11■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.293e-11■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 TGOLN2-202ENST00000377386 6489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.873e-11■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 TGOLN2-201ENST00000282120 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.963e-11■□□□□ 8.9
TRA2AQ13595 TFPI-207ENST00000421427 804 ntTSL 39.65□□□□□ -0.863e-8■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.433e-8■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 TFPI-209ENST00000437725 545 ntTSL 45.38□□□□□ -1.553e-8■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.743e-8■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 TFPI-210ENST00000453013 733 ntTSL 24.1□□□□□ -1.753e-8■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.763e-8■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 TFPI-205ENST00000417013 554 ntTSL 23.22□□□□□ -1.893e-8■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.123e-9■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.033e-9■□□□□ 8.8
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TRA2AQ13595 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.113e-9■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 SERF2-208ENST00000409617 700 ntTSL 214.37□□□□□ -0.113e-9■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.213e-9■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 SERF2-212ENST00000445816 2099 ntTSL 313.37□□□□□ -0.273e-9■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.323e-9■□□□□ 8.8
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TRA2AQ13595 SERF2-215ENST00000475927 692 ntTSL 212.85□□□□□ -0.353e-9■□□□□ 8.8
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TRA2AQ13595 SERF2-210ENST00000409960 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.523e-9■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 SERF2-213ENST00000448830 2792 ntTSL 211.74□□□□□ -0.533e-9■□□□□ 8.8
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TRA2AQ13595 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.252e-6■□□□□ 8.8
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TRA2AQ13595 FBXO7-203ENST00000420700 1900 ntTSL 515.88■□□□□ 0.132e-6■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.052e-6■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.032e-6■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 LIG1-206ENST00000594067 2697 ntTSL 214.16□□□□□ -0.142e-6■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 LIG1-208ENST00000595758 606 ntTSL 413.95□□□□□ -0.182e-6■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.386e-14■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.446e-14■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 FBXO7-205ENST00000444207 747 ntTSL 212.29□□□□□ -0.442e-6■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.476e-14■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 PRAME-203ENST00000402697 2057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.566e-14■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.596e-14■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 PRAME-213ENST00000492657 2831 ntTSL 1 (best)11.3□□□□□ -0.66e-14■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.632e-6■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 HERC1-214ENST00000561400 2215 ntTSL 211.09□□□□□ -0.632e-6■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 LIG1-209ENST00000596104 531 ntTSL 39.97□□□□□ -0.812e-6■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 FBXO7-209ENST00000492535 6884 ntTSL 56.94□□□□□ -1.32e-6■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.312e-6■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 SPAG5-216ENST00000584206 715 ntTSL 46.49□□□□□ -1.372e-6■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.492e-6■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 TAX1BP1-208ENST00000457186 1174 ntTSL 55.39□□□□□ -1.552e-6■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 TAX1BP1-204ENST00000416801 2221 ntTSL 25.33□□□□□ -1.562e-6■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.672e-6■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 FBXO7-207ENST00000465418 413 ntTSL 53.79□□□□□ -1.82e-6■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.832e-6■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 CNOT1-217ENST00000569263 304 ntTSL 212.65□□□□□ -0.388e-8■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 SUPT16H-202ENST00000552829 669 ntTSL 211.47□□□□□ -0.578e-8■□□□□ 8.8
TRA2AQ13595 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.4□□□□□ -2.192e-51■□□□□ 8.7
TRA2AQ13595 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.384e-7■□□□□ 8.7
TRA2AQ13595 WWC2-209ENST00000513834 4887 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.494e-7■□□□□ 8.7
TRA2AQ13595 WWC2-204ENST00000448232 6356 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.74e-7■□□□□ 8.7
TRA2AQ13595 WWC2-205ENST00000504005 5247 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.724e-7■□□□□ 8.7
TRA2AQ13595 WWC2-202ENST00000427431 6373 ntTSL 29.65□□□□□ -0.864e-7■□□□□ 8.7
TRA2AQ13595 PEG3-210ENST00000600833 1558 ntTSL 1 (best)8.84□□□□□ -0.994e-7■□□□□ 8.7
TRA2AQ13595 WWC2-203ENST00000438543 3824 ntTSL 26.97□□□□□ -1.294e-7■□□□□ 8.7
TRA2AQ13595 WWC2-210ENST00000515284 641 ntTSL 52.7□□□□□ -1.984e-7■□□□□ 8.7
TRA2AQ13595 PFKL-205ENST00000466134 5986 ntTSL 217.9■□□□□ 0.466e-6■□□□□ 8.7
TRA2AQ13595 PFKL-207ENST00000474114 6007 ntTSL 1 (best)15.99■□□□□ 0.156e-6■□□□□ 8.7
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