Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PMS2P3Q13401 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMS2P3Q13401 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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