Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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