Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 LIN54-210ENST00000510877 4507 ntTSL 1 (best)12.76□□□□□ -0.373e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 NSUN4-207ENST00000495427 2126 ntTSL 212.29□□□□□ -0.443e-7■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ODF2-208ENST00000432065 934 ntTSL 512.27□□□□□ -0.451e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ZEB2-233ENST00000636179 8984 ntTSL 512.22□□□□□ -0.451e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.451e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 TFCP2-203ENST00000548108 1508 ntTSL 1 (best)12.09□□□□□ -0.471e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.481e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 EZR-201ENST00000337147 3068 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.511e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.551e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 LIN54-206ENST00000506560 2757 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.563e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 NSUN4-204ENST00000474844 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.583e-7■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ERV3-1-202ENST00000528878 1729 ntTSL 211.42□□□□□ -0.581e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 EZR-203ENST00000392177 2933 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.621e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 NSUN4-202ENST00000469918 865 ntTSL 311.2□□□□□ -0.623e-7■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 FNBP4-201ENST00000263773 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.631e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ZEB2-239ENST00000637045 9091 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.641e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ODF2-206ENST00000393533 2086 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.661e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 TPT1-AS1-205ENST00000517509 3456 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.666e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ZEB2-236ENST00000636471 9583 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.731e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ZEB2-224ENST00000539609 4061 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.741e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 LIN54-203ENST00000446851 4083 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.773e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 NSUN4-209ENST00000537428 2087 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.773e-7■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ODF2-219ENST00000546203 2140 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.791e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 LIN54-207ENST00000508171 2684 ntTSL 1 (best)10.09□□□□□ -0.793e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 LIN54-202ENST00000442461 4254 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.813e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ODF2-203ENST00000372807 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.821e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ODF2-207ENST00000421776 1254 ntTSL 1 (best)9.91□□□□□ -0.821e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ZEB2-245ENST00000638087 9339 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.841e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 NACA-213ENST00000549855 711 ntTSL 59.8□□□□□ -0.841e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ODF2-201ENST00000351030 3899 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.871e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 PTBP3-208ENST00000487997 389 ntTSL 39.45□□□□□ -0.91e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ODF2-215ENST00000470061 588 ntTSL 39.44□□□□□ -0.91e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 TPT1-AS1-218ENST00000523445 856 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.911e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ODF2-210ENST00000444119 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.921e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 GNGT1-205ENST00000455502 1943 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.941e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ZEB2-201ENST00000303660 3913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.011e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.041e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ZEB2-247ENST00000639389 1414 ntTSL 58.56□□□□□ -1.041e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 NSUN4-201ENST00000307089 4344 ntTSL 1 (best)8.34□□□□□ -1.073e-7■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ODF2-209ENST00000434106 3890 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.121e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 TPT1-AS1-214ENST00000521507 665 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.151e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 TPT1-AS1-212ENST00000520924 553 ntTSL 47.84□□□□□ -1.151e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ODF2-218ENST00000497812 578 ntTSL 47.78□□□□□ -1.161e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ZEB2-205ENST00000419938 1755 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.171e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ZEB2-232ENST00000636026 5172 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.181e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ODF2-220ENST00000604420 3030 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.181e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 TPT1-AS1-221ENST00000618947 520 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.191e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 TPT1-AS1-213ENST00000521336 759 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.21e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ZEB2-238ENST00000636820 9115 ntTSL 57.24□□□□□ -1.251e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.293e-7■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.361e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 AC087633.2-206ENST00000614581 513 ntTSL 56.42□□□□□ -1.381e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.381e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.451e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.451e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 TLK1-209ENST00000470340 521 ntTSL 45.64□□□□□ -1.512e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 GGNBP2-217ENST00000619573 2281 ntTSL 24.95□□□□□ -1.621e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.631e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 CAPN7-202ENST00000415565 742 ntTSL 54.69□□□□□ -1.661e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 CPSF6-206ENST00000550987 560 ntTSL 44.6□□□□□ -1.671e-5■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.911e-10■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.851e-10■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.41e-10■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 BAZ1A-206ENST00000553853 433 ntTSL 33.69□□□□□ -1.821e-10■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 BAZ1A-205ENST00000553573 445 ntTSL 33.55□□□□□ -1.841e-10■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 SYMPK-212ENST00000598896 1899 ntTSL 1 (best)22.62■■□□□ 1.219e-9■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 SYMPK-208ENST00000598059 611 ntTSL 421.27■■□□□ 19e-9■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 SYMPK-205ENST00000594293 623 ntTSL 417.59■□□□□ 0.419e-9■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 SYMPK-204ENST00000593959 546 ntTSL 416.4■□□□□ 0.229e-9■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 SYMPK-202ENST00000593504 5107 ntTSL 214.85□□□□□ -0.039e-9■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.079e-9■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 SYMPK-218ENST00000602061 503 ntTSL 412.76□□□□□ -0.379e-9■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.49e-9■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.382e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.392e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.412e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 RNF43-203ENST00000577716 4367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.732e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 RNF43-207ENST00000583753 3560 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.852e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 BAIAP2L1-202ENST00000462558 1250 ntTSL 1 (best)17.18■□□□□ 0.342e-9■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.52e-9■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 BAIAP2L1-204ENST00000479789 521 ntTSL 38.41□□□□□ -1.062e-9■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.649e-7■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.289e-7■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.129e-7■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 OLA1-206ENST00000428402 1270 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.179e-7■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 SH3D19-204ENST00000427414 2656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.111e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 SH3D19-207ENST00000478503 4038 ntTSL 25.67□□□□□ -1.51e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.591e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.081e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.381e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.661e-6■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.052e-7■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 SNX6-206ENST00000556162 1855 ntTSL 213.97□□□□□ -0.172e-7■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 SNX6-203ENST00000555416 1215 ntTSL 1 (best)13.54□□□□□ -0.242e-7■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 SNX6-201ENST00000362031 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.732e-7■■■■□ 19.3
ILF3Q12906 KCMF1-204ENST00000456682 661 ntTSL 325.95■■□□□ 1.742e-6■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 SLC47A1-207ENST00000573009 1317 ntTSL 218.86■□□□□ 0.612e-6■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 KCMF1-202ENST00000428691 560 ntTSL 218.32■□□□□ 0.522e-6■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.52e-6■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 SLC47A1-205ENST00000497548 1900 ntTSL 217.08■□□□□ 0.322e-6■■■□□ 19.2
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