Protein–RNA interactions for Protein: Q12386

ARP8, Actin-like protein ARP8, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 881 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ARP8Q12386 SEC3YER008C 4011 nt2.83□□□□□ -1.96
ARP8Q12386 UBR2YLR024C 5619 nt2.83□□□□□ -1.96
ARP8Q12386 SPF1YEL031W 3648 nt2.82□□□□□ -1.96
ARP8Q12386 YKL225WYKL225W 348 nt2.82□□□□□ -1.96
ARP8Q12386 YOR055WYOR055W 435 nt2.82□□□□□ -1.96
ARP8Q12386 LCL1YPL056C 306 nt2.82□□□□□ -1.96
ARP8Q12386 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt2.82□□□□□ -1.96
ARP8Q12386 HER1YOR227W 3741 nt2.81□□□□□ -1.96
ARP8Q12386 SAC3YDR159W 3906 nt2.81□□□□□ -1.96
ARP8Q12386 ARP8YOR141C 2646 nt2.8□□□□□ -1.96
ARP8Q12386 STO1YMR125W 2586 nt2.8□□□□□ -1.96
ARP8Q12386 SKI3YPR189W 4299 nt2.8□□□□□ -1.96
ARP8Q12386 PDR11YIL013C 4236 nt2.8□□□□□ -1.96
ARP8Q12386 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt2.77□□□□□ -1.97 RIP-Chip
ARP8Q12386 SEC31YDL195W 3822 nt2.76□□□□□ -1.97
ARP8Q12386 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt2.75□□□□□ -1.97
ARP8Q12386 SMC4YLR086W 4257 nt2.74□□□□□ -1.97
ARP8Q12386 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt2.74□□□□□ -1.97
ARP8Q12386 MSB1YOR188W 3414 nt2.74□□□□□ -1.97
ARP8Q12386 ATG9YDL149W 2994 nt2.73□□□□□ -1.97
ARP8Q12386 YER078W-AYER078W-A 165 nt2.72□□□□□ -1.97
ARP8Q12386 ANS1YHR126C 480 nt2.72□□□□□ -1.97
ARP8Q12386 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt2.72□□□□□ -1.97
ARP8Q12386 SEC8YPR055W 3198 nt2.71□□□□□ -1.98 RIP-Chip
ARP8Q12386 MSH3YCR092C 3057 nt2.71□□□□□ -1.98
ARP8Q12386 ULP2YIL031W 3105 nt2.69□□□□□ -1.98
ARP8Q12386 VPS13YLL040C 9435 nt2.68□□□□□ -1.98
ARP8Q12386 INO80YGL150C 4470 nt2.68□□□□□ -1.98 RIP-Chip
ARP8Q12386 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt2.68□□□□□ -1.98
ARP8Q12386 IRC20YLR247C 4671 nt2.68□□□□□ -1.98
ARP8Q12386 BEM3YPL115C 3387 nt2.67□□□□□ -1.98
ARP8Q12386 MYO4YAL029C 4416 nt2.67□□□□□ -1.98
ARP8Q12386 NST1YNL091W 3723 nt2.67□□□□□ -1.98
ARP8Q12386 MSN5YDR335W 3675 nt2.65□□□□□ -1.98
ARP8Q12386 PRP16YKR086W 3216 nt2.65□□□□□ -1.98
ARP8Q12386 YSP1YHR155W 3687 nt2.64□□□□□ -1.99
ARP8Q12386 TRA1YHR099W 11235 nt2.64□□□□□ -1.99
ARP8Q12386 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt2.64□□□□□ -1.99
ARP8Q12386 IRA2YOL081W 9240 nt2.64□□□□□ -1.99
ARP8Q12386 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt2.63□□□□□ -1.99
ARP8Q12386 EST1YLR233C 2100 nt2.63□□□□□ -1.99
ARP8Q12386 APL3YBL037W 3078 nt2.62□□□□□ -1.99
ARP8Q12386 TRM732YMR259C 4263 nt2.62□□□□□ -1.99
ARP8Q12386 GEA2YEL022W 4380 nt2.61□□□□□ -1.99
ARP8Q12386 snR75snR75 89 nt2.61□□□□□ -1.99
ARP8Q12386 SWI4YER111C 3282 nt2.61□□□□□ -1.99
ARP8Q12386 SCD5YOR329C 2619 nt2.6□□□□□ -1.99
ARP8Q12386 UTP22YGR090W 3714 nt2.6□□□□□ -1.99 RIP-Chip
ARP8Q12386 CSF1YLR087C 8877 nt2.59□□□□□ -1.99
ARP8Q12386 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt2.59□□□□□ -1.99
ARP8Q12386 UBP2YOR124C 3819 nt2.58□□□□□ -2
ARP8Q12386 PET127YOR017W 2403 nt2.58□□□□□ -2
ARP8Q12386 snR69snR69 101 nt2.57□□□□□ -2
ARP8Q12386 BRE1YDL074C 2103 nt2.56□□□□□ -2
ARP8Q12386 USO1YDL058W 5373 nt2.55□□□□□ -2
ARP8Q12386 DNF1YER166W 4716 nt2.53□□□□□ -2.01 RIP-Chip
ARP8Q12386 BNI1YNL271C 5862 nt2.52□□□□□ -2.01
ARP8Q12386 YOL098CYOL098C 3114 nt2.52□□□□□ -2.01
ARP8Q12386 NUP145YGL092W 3954 nt2.52□□□□□ -2.01
ARP8Q12386 snR38snR38 95 nt2.52□□□□□ -2.01
ARP8Q12386 AI1Q0050 2505 nt2.51□□□□□ -2.01 RIP-Chip
ARP8Q12386 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt2.51□□□□□ -2.01
ARP8Q12386 RPL41AYDL184C 78 nt2.51□□□□□ -2.01
ARP8Q12386 BPH1YCR032W 6504 nt2.49□□□□□ -2.01
ARP8Q12386 CSE1YGL238W 2883 nt2.49□□□□□ -2.01
ARP8Q12386 RDS3YPR094W 324 nt2.49□□□□□ -2.01
ARP8Q12386 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt2.48□□□□□ -2.01
ARP8Q12386 YML054C-AYML054C-A 159 nt2.48□□□□□ -2.01
ARP8Q12386 SEC16YPL085W 6588 nt2.48□□□□□ -2.01
ARP8Q12386 MON2YNL297C 4911 nt2.48□□□□□ -2.01
ARP8Q12386 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.47□□□□□ -2.01
ARP8Q12386 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt2.47□□□□□ -2.01
ARP8Q12386 SXM1YDR395W 2835 nt2.43□□□□□ -2.02 RIP-Chip
ARP8Q12386 NIP1YMR309C 2439 nt2.42□□□□□ -2.02
ARP8Q12386 SKI7YOR076C 2244 nt2.41□□□□□ -2.02
ARP8Q12386 TOR2YKL203C 7425 nt2.4□□□□□ -2.03
ARP8Q12386 CLU1YMR012W 3834 nt2.4□□□□□ -2.03
ARP8Q12386 DGR1YNL130C-A 147 nt2.39□□□□□ -2.03
ARP8Q12386 NUP188YML103C 4968 nt2.38□□□□□ -2.03
ARP8Q12386 CDC39YCR093W 6327 nt2.37□□□□□ -2.03
ARP8Q12386 PMD1YER132C 5262 nt2.35□□□□□ -2.03
ARP8Q12386 TMA7YLR262C-A 195 nt2.35□□□□□ -2.03
ARP8Q12386 HUG1YML058W-A 207 nt2.34□□□□□ -2.03
ARP8Q12386 FAB1YFR019W 6837 nt2.34□□□□□ -2.04
ARP8Q12386 YMR045CYMR045C 5268 nt2.32□□□□□ -2.04
ARP8Q12386 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt2.32□□□□□ -2.04
ARP8Q12386 SPP41YDR464W 4308 nt2.31□□□□□ -2.04
ARP8Q12386 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt2.31□□□□□ -2.04
ARP8Q12386 BST1YFL025C 3090 nt2.31□□□□□ -2.04
ARP8Q12386 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.3□□□□□ -2.04
ARP8Q12386 YOR093CYOR093C 4947 nt2.28□□□□□ -2.04
ARP8Q12386 PAU12YGR294W 363 nt2.26□□□□□ -2.05
ARP8Q12386 SIP4YJL089W 2490 nt2.26□□□□□ -2.05
ARP8Q12386 BUL2YML111W 2763 nt2.26□□□□□ -2.05
ARP8Q12386 EST2YLR318W 2655 nt2.24□□□□□ -2.05
ARP8Q12386 NEO1YIL048W 3456 nt2.23□□□□□ -2.05
ARP8Q12386 FIG2YCR089W 4830 nt2.23□□□□□ -2.05
ARP8Q12386 CFT1YDR301W 4074 nt2.23□□□□□ -2.05
ARP8Q12386 NUP192YJL039C 5052 nt2.23□□□□□ -2.05
ARP8Q12386 LAA1YJL207C 6045 nt2.21□□□□□ -2.06
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