Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 STH1YIL126W 4080 nt2.39□□□□□ -2.03
TFB4Q12004 CSF1YLR087C 8877 nt2.39□□□□□ -2.03
TFB4Q12004 ARP8YOR141C 2646 nt2.38□□□□□ -2.03
TFB4Q12004 BNI1YNL271C 5862 nt2.38□□□□□ -2.03
TFB4Q12004 SPF1YEL031W 3648 nt2.38□□□□□ -2.03
TFB4Q12004 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt2.37□□□□□ -2.03
TFB4Q12004 PDR1YGL013C 3207 nt2.36□□□□□ -2.03
TFB4Q12004 HER1YOR227W 3741 nt2.35□□□□□ -2.03
TFB4Q12004 snR75snR75 89 nt2.35□□□□□ -2.03
TFB4Q12004 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt2.35□□□□□ -2.03
TFB4Q12004 SMC4YLR086W 4257 nt2.35□□□□□ -2.03
TFB4Q12004 STO1YMR125W 2586 nt2.35□□□□□ -2.03
TFB4Q12004 KAP122YGL016W 3246 nt2.34□□□□□ -2.03
TFB4Q12004 YLR422WYLR422W 5799 nt2.33□□□□□ -2.04
TFB4Q12004 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt2.33□□□□□ -2.04
TFB4Q12004 ANS1YHR126C 480 nt2.32□□□□□ -2.04
TFB4Q12004 YOR055WYOR055W 435 nt2.32□□□□□ -2.04
TFB4Q12004 GEA2YEL022W 4380 nt2.31□□□□□ -2.04
TFB4Q12004 MYO4YAL029C 4416 nt2.31□□□□□ -2.04
TFB4Q12004 SLN1YIL147C 3663 nt2.31□□□□□ -2.04
TFB4Q12004 BEM3YPL115C 3387 nt2.3□□□□□ -2.04
TFB4Q12004 SIR4YDR227W 4077 nt2.3□□□□□ -2.04
TFB4Q12004 PKH3YDR466W 2697 nt2.3□□□□□ -2.04
TFB4Q12004 MGA2YIR033W 3342 nt2.3□□□□□ -2.04
TFB4Q12004 USO1YDL058W 5373 nt2.28□□□□□ -2.04
TFB4Q12004 SAC3YDR159W 3906 nt2.28□□□□□ -2.04
TFB4Q12004 YOL098CYOL098C 3114 nt2.28□□□□□ -2.04
TFB4Q12004 SCD5YOR329C 2619 nt2.27□□□□□ -2.05
TFB4Q12004 YCS4YLR272C 3531 nt2.27□□□□□ -2.05
TFB4Q12004 TOR2YKL203C 7425 nt2.26□□□□□ -2.05
TFB4Q12004 YMR045CYMR045C 5268 nt2.26□□□□□ -2.05
TFB4Q12004 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt2.26□□□□□ -2.05
TFB4Q12004 KCS1YDR017C 3153 nt2.26□□□□□ -2.05
TFB4Q12004 SKI3YPR189W 4299 nt2.24□□□□□ -2.05
TFB4Q12004 MSB1YOR188W 3414 nt2.24□□□□□ -2.05
TFB4Q12004 EST1YLR233C 2100 nt2.24□□□□□ -2.05
TFB4Q12004 PRP16YKR086W 3216 nt2.23□□□□□ -2.05
TFB4Q12004 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt2.23□□□□□ -2.05
TFB4Q12004 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt2.22□□□□□ -2.05
TFB4Q12004 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt2.22□□□□□ -2.05
TFB4Q12004 SEC8YPR055W 3198 nt2.21□□□□□ -2.06
TFB4Q12004 SEC3YER008C 4011 nt2.21□□□□□ -2.06
TFB4Q12004 BRE1YDL074C 2103 nt2.2□□□□□ -2.06
TFB4Q12004 PET127YOR017W 2403 nt2.19□□□□□ -2.06
TFB4Q12004 snR69snR69 101 nt2.18□□□□□ -2.06
TFB4Q12004 RPL41AYDL184C 78 nt2.18□□□□□ -2.06
TFB4Q12004 INO80YGL150C 4470 nt2.18□□□□□ -2.06
TFB4Q12004 TFC3YAL001C 3483 nt2.18□□□□□ -2.06
TFB4Q12004 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt2.17□□□□□ -2.06
TFB4Q12004 DNF1YER166W 4716 nt2.17□□□□□ -2.06
TFB4Q12004 ULP2YIL031W 3105 nt2.17□□□□□ -2.06
TFB4Q12004 APL3YBL037W 3078 nt2.16□□□□□ -2.06
TFB4Q12004 ATG9YDL149W 2994 nt2.16□□□□□ -2.06
TFB4Q12004 YML054C-AYML054C-A 159 nt2.16□□□□□ -2.06
TFB4Q12004 YSP1YHR155W 3687 nt2.15□□□□□ -2.07
TFB4Q12004 IRC20YLR247C 4671 nt2.15□□□□□ -2.07
TFB4Q12004 UTP22YGR090W 3714 nt2.15□□□□□ -2.07
TFB4Q12004 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt2.14□□□□□ -2.07
TFB4Q12004 snR38snR38 95 nt2.14□□□□□ -2.07
TFB4Q12004 MON2YNL297C 4911 nt2.14□□□□□ -2.07
TFB4Q12004 SKI7YOR076C 2244 nt2.13□□□□□ -2.07
TFB4Q12004 AI1Q0050 2505 nt2.13□□□□□ -2.07
TFB4Q12004 CDC25YLR310C 4770 nt2.13□□□□□ -2.07
TFB4Q12004 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt2.12□□□□□ -2.07
TFB4Q12004 CSE1YGL238W 2883 nt2.12□□□□□ -2.07
TFB4Q12004 SPP41YDR464W 4308 nt2.11□□□□□ -2.07
TFB4Q12004 SXM1YDR395W 2835 nt2.1□□□□□ -2.07
TFB4Q12004 SWI4YER111C 3282 nt2.1□□□□□ -2.07
TFB4Q12004 RDS3YPR094W 324 nt2.1□□□□□ -2.07
TFB4Q12004 FKS1YLR342W 5631 nt2.09□□□□□ -2.07
TFB4Q12004 TRM732YMR259C 4263 nt2.09□□□□□ -2.08
TFB4Q12004 YOR093CYOR093C 4947 nt2.09□□□□□ -2.08
TFB4Q12004 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt2.08□□□□□ -2.08
TFB4Q12004 PMD1YER132C 5262 nt2.07□□□□□ -2.08
TFB4Q12004 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt2.07□□□□□ -2.08
TFB4Q12004 MSH3YCR092C 3057 nt2.06□□□□□ -2.08
TFB4Q12004 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt2.06□□□□□ -2.08
TFB4Q12004 TMA7YLR262C-A 195 nt2.05□□□□□ -2.08
TFB4Q12004 MSN5YDR335W 3675 nt2.05□□□□□ -2.08
TFB4Q12004 NIP1YMR309C 2439 nt2.05□□□□□ -2.08
TFB4Q12004 NST1YNL091W 3723 nt2.04□□□□□ -2.08
TFB4Q12004 UBP2YOR124C 3819 nt2.04□□□□□ -2.08
TFB4Q12004 SEC31YDL195W 3822 nt2.03□□□□□ -2.08
TFB4Q12004 NUP145YGL092W 3954 nt2.02□□□□□ -2.09
TFB4Q12004 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.02□□□□□ -2.09
TFB4Q12004 NEO1YIL048W 3456 nt2.01□□□□□ -2.09
TFB4Q12004 HUG1YML058W-A 207 nt2.01□□□□□ -2.09
TFB4Q12004 NUP188YML103C 4968 nt1.99□□□□□ -2.09
TFB4Q12004 DGR1YNL130C-A 147 nt1.97□□□□□ -2.09
TFB4Q12004 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.96□□□□□ -2.1
TFB4Q12004 FAB1YFR019W 6837 nt1.94□□□□□ -2.1
TFB4Q12004 PAU12YGR294W 363 nt1.94□□□□□ -2.1
TFB4Q12004 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt1.93□□□□□ -2.1
TFB4Q12004 CDC39YCR093W 6327 nt1.92□□□□□ -2.1
TFB4Q12004 SIP4YJL089W 2490 nt1.91□□□□□ -2.1
TFB4Q12004 BUL2YML111W 2763 nt1.9□□□□□ -2.1
TFB4Q12004 DNF3YMR162C 4971 nt1.89□□□□□ -2.11
TFB4Q12004 BST1YFL025C 3090 nt1.88□□□□□ -2.11
TFB4Q12004 CFT1YDR301W 4074 nt1.87□□□□□ -2.11
TFB4Q12004 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.87□□□□□ -2.11
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